METAGENOMIC ANALYSIS FOR HONEY BEE VIRUSES INDICATION BY MULTIPRIMER PCR

Keywords: Apis mellifera L., multiprimer PCR, Sacbrood virus, Acute bee paralysis virus, Black queen cell virus, Deformed wing virus

Abstract

The purpose of this work was the design of primers for indication and identification of the causative agents of bee viral diseases (sacbrood, acute bee paralysis, black queen cell, deformed wing) by multiprimer PCR. Using the bioinformatics techniques, the design of the oligonucleotide primers was performed, which had similar annealing temperatures (60 °C) that allows each of the viruses to be identified under the same PCR conditions. Most of the known strains and isolates of these viruses are amplified with designed complex of oligonucleotide primers. Nucleotide sequences of primers and universal positive control allow genetic identification each of the presented biopathogens under the same PCR conditions at multiprimer format.

Downloads

Download data is not yet available.

Author Biographies

Альфия Василевна Хаммадова, Kazan Federal University

Magistrandt

Малик Нилович Мукминов, Kazan Federal University

Doctor of Biological Sciences, Professor

Эдуард Аркадьевич Шуралев, Kazan Federal University

Candidate of Veterinary Sciences, Leading Researcher

Наиль Ильдарович Хаммадов, Federal Center for Toxicological, Radiation and Biological Safety

Candidate of Biological Sciences, Leading Researcher

Тагир Хадиевич Фаизов, Federal Center for Toxicological, Radiation and Biological Safety

Doctor of Veterinary Sciences

References

1. Биоинформационный анализ олигонуклеотидов для молекулярно-генетической индикации возбудителей аспергиллеза и аскосфероза пчел / Э.В. Ндайишимийе [и др.] // Ветеринарный врач. – 2015. – № 2. – С. 3–9.
2. Генетическая дифференциация популяций медоносных пчел (Apis mellifera L.) и распространение РНК-содержащих вирусов на фоне эпизоотии клеща Varroa destructor на территории Удмуртии / А.Е. Калашников [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – № 4. – С. 88–92.
3. Горбунов А.В., Нефедова Н.С. Варрооз медоносной пчелы (Apis mellifera) в Саратовской области // Вестник Саратовского госагроуниверситета им. Н.И. Вавилова. – 2012. – № 7. – С. 18–19.
4. Калашников А.Е., Удина И.Г. Распространение РНК-содержащих пчел у медоносной пчелы (Apis mellifera) в отдельных регионах России // Молекулярная генетика, микробиология и вирусология. – 2017. – Т. 35. – № 1. – С. 31–35.
5. Клиническая и лабораторная диагностика заразных болезней расплода пчел / М.И. Гулюкин [и др.] // Ветеринария. – 2016. – № 4. – С. 25–27.
6. Оценка перспектив развития пчеловодства в Южной провинции Замбии / М.Н. Мукминов [и др.] // Ветеринария. – 2015. – № 10. – С. 49–52.
7. Оценка территории провинции Коппербелт Республики Замбия по уровню полиметаллического загрязнения для ведения пчеловодства / Э.В. Ндайишимийе [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. – 2015. – № 3(15). – С. 80–84.
8. Основные научные направления и итоги деятельности лаборатории ветеринарной санитарии в пчеловодстве /А.М. Смирнов [и др.] // Российский журнал Проблемы ветеринарной санитарии, гигиены и экологии. – 2015. – № 1(13). – С. 26–31.
9. Поражение медоносной пчелы вирусами и паразитами и состояние пчелиных семей в разных эколого-географических условиях Большого Кавказа / Е.М. Ханбекова [и др.] // Сельскохозяйственная биология. – 2013. – № 6. – С. 43–54.
10. Угрозы распространения вирусных инфекций у пчел (Apis mellifera L.) и роль клеща Varroa destructor в развитии патологий / А.В. Спрыгин [и др.] // Сельскохозяйственная билогия. – 2016. – Т. 51. – № 2. – С. 156–171.
11. Bernardi S., Venturino E. Viral epidemiology of the adult Apis mellifera infested by the Varroa destructor mite // Heliyon, 2016, V. 2(5), 43 рр.
12. Bilalov F., Skrebneva L., Nikitin O., Shuralev E.A., Mukminov M. Seasonal variation in heavy-metal accumulation in honey bees as an indicator of environmental pollution // Research Journal of Pharmaceutical, Biological and Chemical Sciences. – 2015, V. 6(4), P. 215–221.
13. Fujiyuki T., Takeuchi H., Ono M., Ohka S., Sasaki T., Nomoto A., Kubo T. Novel insect picorna-like virus identified in the brains of aggressive worker honeybees // Journal of Virology, 2004, V. 78(3), P. 1093–1100.
14. Reddy K.E., Yoo M.S., Kim Y.H., Kim N.H., Ramya M., Jung H.N., Thao le T.B., Lee H.S., Kang S.W. Homology differences between complete Sacbrood virus genomes from infected Apis mellifera and Apis cerana honeybees in Korea // Virus Genes, 2016, V. 52(2), P. 281–289.
15. Tehel A., Brown M.J., Paxton R.J. Impact of managed honey bee viruses on wild bees // Current Opinion in Virology, 2016, V. 19, P. 16–22.
16. Tsevegmid K., Neumann P., Yañez O. The honey bee pathosphere of Mongolia: European viruses in Central Asia // PLOS One, 2016, V. 11(3).
Published
2018-11-08
Section
Естественные науки