ОЦЕНКА ГЕНЕТИЧЕСКОГО РАЗНООБРАЗИЯ МЕСТНЫХ СОРТОВ И ФОРМ ЯБЛОНИ АЗЕРБАЙДЖАНА С ИСПОЛЬЗОВАНИЕМ ISSR-МАРКЕРОВ
Ключевые слова:
яблоня, молекулярные маркеры, ISSR- праймеры, генетический полиморфизм, кластерный анализАннотация
В статье представлены результаты исследований, впервые проведенные на местных сортах и формах яблони, культивируемых в Азербайджане, с использованием 5 ISSR-праймеров. В целом было идентифицировано 39 ПЦР-фрагментов, из них 30 оказались полиморфными. В изученной коллекции яблони выявлен высокий уровень полиморфизма (73,34 %) и богатое генетическое разнообразие. В результате анализа полученных данных и на основе значений основных параметров (PIC, EMR, MI, RP, MRp), определяющих меру информативности маркеров, все 5 ISSR апробированных праймеров оказались эффективными для генотипирования образцов яблони, установлены наиболее эффективно работающие – UBC 855, UBC 812 и IS 15. Кластерный анализ позволил сгруппировать изученные образцы в 9 основных групп. Индекс генетического разнообразия варьировал от 0,50 до 0,89.
Скачивания
Библиографические ссылки
2. Садыгов А.Н., Садыгова Н.М. Яблоня в Азербайджане. – Баку: Седа, 2005. – С. 8–9.
3. Сорта яблони и их размножение в Азербайджане (рекомендация). – Баку, 1989. – С. 5–6.
4. Чесноков Ю.Ф. Оценка меры информационного полиморфизма генетического разнообразия // Сельскохозяйственная биология. – 2015. – Т. 5. – С. 571–578.
5. Doyle J.L., Doyle J.J. A rapid DNA isolation procedure for small quantities of fresh leaf tissue // Phytochem. Bull., 1987, Vol. 19, P. 11–15.
6. Fazeli Sh., Sheidai M., Farahani F. Noormohammadi Z. Looking for Genetic Diversity in Iranian Apple Cultivars (Malus ? domestica Borkh.) Journal of Sciences, Islamic Republic of Iran 27(3): 205 - 215 (2016) http://jsciences.ut.ac.ir University of Tehran.
7. Goulao L., Oliveira C. M. Molecular characterization of cultivars of apple (Malus ? domestica Borkh.) using microsatellite (SSR and ISSR) markers. Euphytica, 122: 81–89 (2001).
8. Genetic diversity and relationships in Malus sp. germplasm collections as determined by randomly amplified polymorphic DNA / N.C. Oraguize et al. // Journal of the American Society for Horticultural Science, 2001, Т. 126, No. 3. – P. 318–328.
9. Microsatellites in Malus ? domestica (apple): abundance, polymorphism and cultivar identification / P. Guilford, S. Prakash, J. M. Zhu, E. Rikkerink, S. Gardiner, H. Bassett, R. Forster // Theoretical and Applied Genetics. 1997, Т. 94, No. 2, P. 249–254.
10. Hammer O., Harper D.A., Ryan P.D. Past: paleontological statistics software package for education and data analysis // Palaeontologia Electronica, 2001, Vol. 4, P. 1–9.
11. Prevost A., Wilkinson M.J. A new system of comparing PCR primers applied to ISSR fingerprinting of potato cultivars // Theor. Appl. Genet. 1999, Vol. 98, P. 107–112.
12. Roldan-Ruiz I., Dendauw J., Vanbockstaele E. AFLP markers reveal high polymorphic rates in ryegrasses (Lolium spp.) // Mol. Breed, 2000, Vol. 6, P. 125–134.
13. Smolik M., Rzepka-Plevnes D., Stankiewicz I. Analysis of genetic similarity of apple tree cultivars. Folia Horti. 16: 87– 94.
14. The utility of RFLP, RAPD, AFLP and SSR (microsatellite) markers for germplasm analysis / W. Powell et al. // Mol. Breed, 1996, Vol. 2, P. 225–238.
15. Weir B.S. Genetic_Data Analysis Methods for Discrete Genetic Data. Sunderland, MA, USA: Sinauer Assoc. Inc., 1990.
16. Zhou Z.Q., Li Y.N. The RAPD evidence for the phylogenetic relationship of the closely related species of cultivated apple. Genet. Res. Crop Evol. 47: 353357(2000).