Выявление эффективных праймеров для сортов озимой ржи Secale cerealе L.
DOI:
https://doi.org/10.28983/asj.y2023i6pp46-50Ключевые слова:
эффективные ISSR-праймеры, межмикросателлитный анализ, маркеры, озимые сорта, Secale cereale LАннотация
Рожь озимая (Secale cereale L.) является важной продовольственной культурой России. Изучение генетического разнообразия зерновых культур проводится с использованием молекулярных маркеров. Для определения полиморфизма ДНК был использован метод выявления эффективных праймеров ISSR (Inter Simple Sequence Repeats). ISSR-праймеры отбирались по следующим параметрам: 1) наибольшее число полиморфных фрагментов ДНК; 2) четкая амплификация; 3) воспроизводимость при повторных ПЦР. Всего проанализировано 22 ISSR-праймера с тотальной ДНК S. cereale. Из них высокую эффективность продемонстрировали пять ISSR-праймеров для изученных пяти озимых сортов ржи посевной. Для молекулярно-генетического анализа S. cereale были отобраны следующие четыре динуклеотидных ISSR-праймера (M1 (AC)8CG, ISSR-5 (AG)8CA, CR-215 (CT)6TG, CR-218 (GA)6CC) и один тринуклеотидный ISSR-праймер X10 (AGC)6C. Выявленные ISSR-праймеры позволят определить генетическое разнообразие сортов озимой ржи, выращиваемых в условиях Среднего Урала.
Скачивания
Библиографические ссылки
Боронникова С. В. Молекулярно-генетический анализ и оценка состояния генофондов ресурсных видов растений Пермского края: монография. Пермь, 2013. 239 с.
Гончаренко А. А. Состояние производства и селекция озимой ржи в Российской Федерации // Материалы Всероссийской научно-практической конференции, Екатеринбург, 28–29 июня 2012. Екатеринбург, 2012. С. 5–11.
Календарь Р. Н., Боронникова С. В. Анализ молекулярно-генетического полиморфизма природных популяций редких видов растений Урала с помощью ретротранспозонов // Материалы Четвертого Московского междунар. конгресса. М.: ЗАО «Экспо–биохим–технологии»; Изд-во РХТУ им. Д.И. Менделееева, 2007. Ч. 2. С. 121.
Календарь Р. Н., Боронникова С. В. Анализ молекулярно-генетического полиморфизма природных популяций редких видов растений Урала с помощью ретротранспозонов // Биотехнология: состояние и перспективы развития: материалы IV Московского междунар. конгресса. М., 2007. Т. 2. С. 201.
Корзун В. Н. Разработка и применение геномных технологий для молекулярно-генетического картирования и прикладной селекции зерновых культур: дис. … д-ра биол. наук. СПб., 2021. 281 с.
Оптимизация методики выделения ДНК некоторых хвойных видов растений Пермского края / Ю. С. Нечаева [и др.] // Синтез знаний в естественных науках. Рудник будущего: проекты, технологии, оборудование: материалы Междунар. конф. Пермь, 2011. С. 278–282.
Орловская О. А., Корень Л. В., Хотылёва Л. В. ISSR-анализ образцов озимой тритикале (х TriticosecaleWittmack) различного эколого-географического происхождения // Доклады Национальной академии наук Беларуси. 2012. Т. 56. № 2. С. 78–81.
Сухарева А. С., Кулуев Б. Р. ДНК-маркеры для генетического анализа сортов культурных растений // Биомика. 2018. Т. 10. № 1. С. 069–084.
Сысуев В. А., Кедрова Л. И., Уткина Е. И. Рожь-стратегическая зерновая культура в развитии адаптивного растениеводства и обеспечении продовольственной безопасности России // Образование, наука и производство. 2014. № 2(7). С. 31–33.
Уткина Е. И., Кедрова Л. И. Зимостойкость озимой ржи: проблемы и решения // Аграрная наука Евро-Северо-Востока. 2018. № 1(62). С. 11–18.
Федеральная служба государственной статистики. URL: https://clck.ru/aoJYH (дата обращения: 01.09.2022).
Шакирова А. Р. Подбор эффективных ISSR-праймеров для редких видов растений Pulsatilla flavescens (ZUCC.) JUZ. и Pulsatilla patens (L.) MILL // Симбиоз-Россия 2019: материалы XI Всерос. конгресс молодых ученых-биологов с междунар. участием, Пермь, 13–15 мая 2019 г., Перм. гос. нац. исслед. ун-т. Пермь, 2019. 287 с.
The identification of QTLs associated with the in vitro response of rye (Secale cereale L.) / H. Bolibok et al. // Cellular & Molecular Biology Letters. 2007. Т. 12. No. 4. P. 523–535.
Rogers S. O., Bendich A. J. Extraction of DNA from milligram amounts of fresh, herbarium and mummified plant tissues // Plant Molecular Biology. 1985. Vol. l. No. 19. P. 69–76.
Smolik M. R-ISSR-for fingerprinting, mapping and identification of new genomic loci in rye (Secale cereale L.) // Russian Journal of Genetics. 2013. Т. 49. No. 2. P. 187–195.
Zietkiewicz E., Rafalski A., Labuda D. Genome Fingerprinting by Simple Sequence Repeat (SSR)-Anchored Polymerase Chain Reaction Amplification // Genomics. 1994. Т. 20. No. 2. P. 176–183.
Загрузки
Опубликован
Выпуск
Раздел
Лицензия
Copyright (c) 2023 Аграрный научный журнал
Это произведение доступно по лицензии Creative Commons «Attribution-NonCommercial-NoDerivatives» («Атрибуция — Некоммерческое использование — Без производных произведений») 4.0 Всемирная.
